Um welche Mod geht es denn? Wenn Du die auch im Steam Workshop abonniert hast, steht sie dort auch unter Deinen abonnierten Objekten und ist dann auch aktiv. Nichtsdestotrotz musst Du immer erst Deine Mod-Liste bereinigen und danach die Spiele testen, bevor Du Mod-Ordner vom Speicherlaufwerk löschst oder Steam-Mods deabonnierst und das am besten immer erst mit einer Kopie des Spiels. Die Steam-Mods verstecken sich hinter einer ID im Workshop Ordner auf dem Speicherlaufwerk.
Evtl. hilft auch mal ein Blick in die stdout.txt. Die liegt auch in dem crash_dump Ordner.