Hast du denn jetzt den res-Ordner gelöscht und die Dateien durch Steam überprüfen lassen?
(Train Fever-Eintrag in der Bibliothek mit Rechtsklick auswählen >> Eigenschaften >> Lokale Dateien >> Spieldateien auf Fehler überprüfen)
Du kannst dann auch jeden Mod manuell entpacken. Solltest du aber einzeln installieren und testen. Erst wenn ein neu installierter Mod funktioniert, den nächsten installieren. Sonst wird es schwierig, den Verursacher zu finden. Möglicherweise ist auch bei der Installation etwas in den falschen Ordner geraten. Die neueste Versionen des Spiels sollten aber auch eine stdout.txt/stderr.txt im Steam userdata-Verzeichnis erstellen (bei den crash-dumps), in der eventuell auch wichtige Hinweise zu den Crashes stehen.