Hmm, wenn ein durchfahrtsbahnhof nurnoch eingleisig durchfahren wird, dann ist dies ein bug in TF, ich habe das öfters und es zerhagelt mir meine gesamten Linien, dass TF der Meinung ist, auf einer zweigleisigen Strecke mit Richtungsgleisen trotzdem irgendeine der Züge eingleisig fahren zu lassen, dass macht das Spiel gerne mal ohne vorwarnung, dass du dich nur irgendwann mal fragst, wieso denn schon seit ner viertel stunde kein IC mehr durch den Bahnhof gerauscht ist. Abhilfe kannst du hier mit den Wegpunkten schaffen, sodass du einen Zug auf ein Gleis zwingst.
Sollte natürlich, wie Argument shcon sagte, der Zug in dem Bahnhof Kopf machen, so ist eine eingleisige einfahrt völlig normal.