Hm, das lässt sich anhand der Bilder, die du gepostet hast leider nicht eindeutig klären.
Damit der Railjet fahren kann, muss der IC von oben die Weiche links beim Bahnhof vollständig passiert haben, im unteren Gleis (das des Railjet) darf sich kein Zug befinden und es darf auch kein IC von unten her kommend den Gleisabschnitt reserviert haben. Bist Du sicher, dass alle diese Bedingungen erfüllt sind?
In dem Moment, wo der IC von oben wieder abfährt, kann der Railjet auch nicht mehr einfahren. Dann ist ja das Gleis schon durch den abfahrenden IC blockiert.
Wie sieht es eigentlich links vom Bahnhof aus? Sind dort auch noch Signale an der Strecke? Oder ist es ein Kopfbahnhof?
Edit: gerade gesehen, dass Du Kopfbahnhof geschrieben hast. Demnach auch keine weiteren Signale, nehme ich an?
Hast Du mal probiert, Ausfahrsignale an beiden Bahnsteigen zu platzieren?