Es macht keinen Unterschied. Mit der neuen Mod-Struktur sind die Mods in Zukunft besser von den TF-eigenen Bestandteilen getrennt.
Ich handhabe die Mods noch nach der alten Methode ohne Probleme.
Habe nur @DasMatze 628.1er testweise aus dem res-Ordner entfernt und über das neue System meinem Savegame wieder hinzugefügt, da er rel. fix mit einem Update war und es funktioniert ebenso.
Alle die, die den Mod-Manager von @Xanos nutzen, sollten einfach weiter wie bisher mit ihren Mods umgehen. Eine neue Version des TFMM wird dann das ganze Gefrimmel übernehmen...